我以前出现过这种情况，加氢氧化钠后沉淀消失，水溶液颜色加深了。
我一般前处理用蒸馏法，以硼酸为吸收液。一般来说蒸馏法预处理水样比絮凝沉淀法效果较好一些，只是稍微麻烦了点。
你可以试试蒸馏法，馏出液加少许氢氧化钠中和后再加纳氏试剂比色（也可加点酒石酸钾钠溶液作掩蔽）。

另外，前处理很必要，除非你的样品里介质氰尿酸很纯，否则最好选择一种前处理方法。样品里含金属离子就一定要加酒石酸钾钠加以掩蔽。你还可以看看你样品的PH值，显色一定要处于碱性，一般要到10~11（个人觉得）。
不知对你有没有帮助