但是在实际应用中面临着如网络资源匮乏等难题。中国水资源分布分散二广阔，要想建立广覆盖、大面积的水利监控网，将是一笔投资巨大的工程。与此同时，高清视频带来的网络使用费也是不小的开支。
另一方面就是水利安防环境带来的工程复杂性与设备高要求，包括取电、防雷、防高低温、防水、防锈、防盗等，这些因素会增加系统建设与维护成本;再者，从水利部门的建设规划意图，是希望建立全流域、全水系的水资源监管监测体系，因此需要信息互通、共享，但目前很多建设现状还是分散建设，厂家林立，缺乏标准化，导致在区县到地市、地市到省水利厅、省厅到流域委员会各环节存在互联互通的瓶颈，造成在大量投资后，却出现省防办领导看不到省内某个水库画面的情况。
当然，智能水利并非遥不可及。在高新兴陈刚看来，未来几年，网络建设的加强和物联网技术的发展(如WSN与MANET)将在很大程度上推动水利安防的应用规模，3G广域网与WSN局域网结合将丰富水利物联网的应用。另外，监控系统的互联互通会成为水利部门重点推进的工作，且作为新建系统的规范要求。水情监测的数据监控与水利安防的视频监控应用将进一步融合，并与水利业务系统进行集成。
